反復解法ライブラリ Lis

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Introduction

Lis (a Library of Iterative Solvers for linear systems) は, 線型方程式及び標準固有値問題を解くためのスケーラブルな並列反復解法ライブラリです.
Lis をインストールするためには, C コンパイラが利用できる計算機環境が必要です. また, Fortran インタフェースを使用するためには FORTRAN 77, 代数的マルチグリッド前処理を使用するためには Fortran 90 に対応したコンパイラも必要となります. 並列計算環境では, OpenMP または MPI を使用します.
Lis は以下の環境において動作が確認されています.

• Version 1.2.35 (2010年7月29日) New!
  • lis-1.2.35.tar.gz (ソースコード)
  • lis-manual-ja.pdf (ユーザマニュアル)
• Version 1.1.2 (2007年12月24日)
  • lis-1.1.2.tar.gz (ソースコード)
  • lis-manual-1.1.2_ja.pdf (ユーザマニュアル)
  • lis-1.1.1-win32.zip (Windows用バイナリパッケージ)
  • lis-for-win-guide-1.1.1.pdf (Lis for Windows利用ガイド)
• ChangeLog

• A. Nishida. Experience in Developing an Open Source Scalable Software Infrastructure in Japan, In Proceedings of Computational Science and its Applications (ICCSA 2010), Part II, Lecture Notes in Computer Science 6017, pp. 87-98, Springer, 2010.
• 西田晃，「複数アーキテクチャ上での疎行列ベクトル積の性能最適化手法」, 情報処理学会研究報告, Vol.2009-ARC-186 No.7, pp.1-8, 2009.
• A. Nishida. Development of General Purpose Numerical Software Infrastructure for Large Scale Scientific Computing, In Annual Report of the Earth Simulator Center, April 2008 - September 2008, The Earth Simulator Center, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, pp.129-133, 2009. (paper)
• 西田晃. 前処理付固有値解法の誤差評価. 情報処理学会研究報告, 2009-HPC-122, No.6, pp.1-6, 2009. (paper)
• A. Nishida, Development of General Purpose Numerical Software Infrastructure for Large Scale Scientific Computing, In Annual Report of the Earth Simulator Center, April 2007 - March 2008, The Earth Simulator Center, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, pp.137-145, 2008. (paper)
• 西田晃. 混合精度型反復解法の提案. 先駆的科学計算に関するフォーラム2008〜高精度・多倍長計算〜, 九州大学情報基盤研究開発センター, 2008. (slides)
• 小武守恒, 藤井昭宏, 長谷川秀彦, 西田晃. 反復法ライブラリ向け4倍精度演算の実装とSSE2を用いた高速化. 情報処理学会論文誌「コンピューティングシステム」, Vol.1, No.1, pp.73-84, 2008.
• 小武守恒. 反復解法ライブラリー Lis の紹介. 線形計算フォーラム, 九州大学情報基盤研究開発センター, 2007. (招待講演, URL, slides)
• 小武守恒, 藤井昭宏, 長谷川秀彦, 西田晃. 高速な4倍精度演算を用いたクリロフ部分空間法の安定化. 第12回日本計算工学会講演会論文集, pp. 631-634, 2007. (ベストペーパーアワード受賞, paper, slides).
• 小武守恒. 4倍精度クリロフ部分空間法の収束比較. 日本応用数理学会平成19年研究部会連合発表会, 2007. (slides)
• 小武守恒. 反復解法ライブラリ Lis による高精度演算とその効果. 研究集会「超大規模行列の数理的諸問題とその高速解法」, 平成15年度日本学術振興会科学研究費補助金 基盤研究(B)(1), 2007. (slides)
• 小武守恒，藤井昭宏，長谷川秀彦，西田晃. 倍精度と4倍精度の混合型反復法の提案. ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム (HPCS2007) 論文集, pp. 9-16, 2007. (paper, slides)
• A. Nishida, H. Kotakemori, T. Kajiyama, and A. Nukada. Scalable Software Infrastructure Project. In Proceedings of the IEEE/ACM SC06 Conference, poster, November 11-17, 2006 (poster).
• 小武守恒，藤井昭宏，長谷川秀彦，西田晃. SSE2を用いた反復解法ライブラリLis 4倍精度版の高速化. IPSJ SIG Notes, 2006(106), pp. 7-12, 情報処理学会, 2006. (paper, slides)
• 小武守恒, 西田晃, キャッシュを考慮した疎行列格納形式 CJDS の提案と評価. 2006年先進的計算基盤システムシンポジウム (SACSIS2006) 論文集, pp.167-174, 情報処理学会, 2006.
• 小武守恒, 藤井昭宏, 長谷川秀彦, 西田晃. Lis: a Library of Iterative Solvers for linear systems. ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム (HPCS2006), ポスター, 情報処理学会, 2006. (paper, poster)
• H. Kotakemori, H. Hasegawa, and A. Nishida, Performance Evaluation of a Parallel Iterative Method Library using OpenMP. In Proceedings of the 8th International Conference on High Performance Computing in Asia Pacific Region (HPC Asia 2005), pp.432-436, IEEE, 2005. (abstract/slides)
• 小武守恒, 長谷川秀彦, 西田晃. OpenMP を用いた並列反復法ライブラリの性能評価. 第34回数値解析シンポジウム講演予稿集, pp.45-48, 2005. (paper)
• H. Kotakemori, H. Hasegawa, T. Kajiyama, A. Nukada, R. Suda, and A. Nishida. Performance Evaluation of Parallel Sparse Matrix-Vector Products on SGI Altix 3700. In Proceedings of the First International Workshop on OpenMP (IWOMP2005), Lecture Notes in Computer Science 4315, pp.153-163, Springer, 2008. (abstract/slides)
• 小武守恒, 藤井昭宏, 中島研吾, 長谷川秀彦, 西田晃. 複数の前処理と格納形式を持つ反復解法ライブラリ. ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム (HPCS2005), ポスター, 情報処理学会, 2005. (poster)
• A. Fujii, A. Nishida, and Y. Oyanagi, Evaluation of Parallel Aggregate Creation Orders : Smoothed Aggregation Algebraic Multigrid Method, In High Performance Computational Science And Engineering, pp.99-122, Springer, 2005.
• 西田晃, 「大規模対称固有値問題への前処理付共役勾配法の適用と評価」, 日本応用数理学会年会予稿集, pp.326-327, 日本応用数理学会, 2003.

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